«Амёбами» - ударение в слове
В указанном выше слове ударение ставят на слог с буквой Ё — амЁбами.
амЁбами.
Амёбами - творительный падеж, множественное число слова амёба
Примеры
Мы бы так и остались амёбами, если бы не энергия, которая толкает нас в будущее. — Павел (Песах) Амнуэль, Конечная остановка (сборник), 2011