«Филогенезом» - ударение в слове

Различие между онто- и филогене́зом задаётся степенью целостности развивающейся системы. — Г. Ю. Любарский, Морфология истории. Сравнительный метод и историческое развитие, 2000

Весь период существования породы от её возникновения до настоящего времени, т. е. эволюцию вида, называют филогене́зом. — Роман Кудрявец, Обрезка садовых растений. Самоучитель в схемах и рисунках, 2020

Превращаясь в общую концепцию, не ограничивающуюся филогене́зом, она вскоре обнаруживает свою ахиллесову пяту, приводя к биологизации человеческой психологии. — С. Л. Рубинштейн, Основы общей психологии, 2020