«Функционировали» - ударение в слове
В таком слове ударение падает на слог со второй буквой И — функционИровали.
функционИровали.
Функционировали - образовано от слова функционировать
Примеры
Там же функциони́ровали пятнадцать домов терпимости, выдержанные также в национальном вкусе. — Алексей Толстой, Гиперболоид инженера Гарина. Аэлита. Похождения Невзорова, или Ибикус