«Сепарированием» - ударение в слове
В упомянутом выше слове ударение ставят на слог с первой буквой И — сепарИрованием.
сепарИрованием.
Сепарированием - творительный падеж слова сепарирование
Примеры
При производстве сливочных напитков сливки получают сепари́рованием молока. — О. В. Богатова, Промышленные технологии производства молочных продуктов, 2013